二者根本區別是在種子的胚中發育二片子葉還是發育一片子葉，二片的稱為雙子葉植物，一片的稱為單子葉植物。
同時，二者可以從根、莖、葉、花進行區分。
根：
雙子葉植物的根系，基本上是直系，主根發達;
單子葉植物的根系基本上是須根系，主根不發達。
莖：雙子葉植物莖內的纖維管束，在橫切面上常排列成圓環狀，有形成層和次生組織;
單子葉植物莖內的纖維管束，為星散排列，無形成層和次生組織，只有初生組織。
葉：
雙子葉植物葉脈為網狀脈;
單子葉植物葉脈為平行脈。
花：
雙子葉植物的萼片、花瓣基數通常是5或者4，沒有3基數，即不是3或者3的倍數，花萼和花冠的形狀多數完全不同。
單子葉植物的花為兩性或者單性，花中的萼片、花瓣的數目通常是3片，或者是3片的倍數。花萼和花冠較相似。
生活中常見的雙子葉植物比如大豆、花生等;單子葉植物如小麥、水稻、玉米、蘭花等。
如圖：前者雙子葉，後者單子葉。
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